Hydroxychloroquine wird auch zur Behandlung von Symptomen von rheumatoider Arthritis und discoidem oder systemischem Lupus erythematodes verwendet. Im Jahr 2020 wurde nach klinischen Studien festgestellt, dass Hydroxychloroquine (der Hauptwirkstoff) in vitro wirksamer als Chloroquine ist, um SARS-CoV-2 (COVID-19-Krankheit) zu hemmen.