Hyoscyamiinia käytetään monien erilaisten maha- ja suolistosairauksien hoitoon, mukaan lukien peptinen haava ja ärtyvän suolen oireyhtymä. Sitä käytetään myös virtsarakon, munuaisten tai ruoansulatuskanavan lihasspasmien hallintaan ja mahahapon vähentämiseen. Hyoscyamiinia käytetään joskus vähentämään vapinaa ja jäykkiä lihaksia ihmisillä, joilla on Parkinsonin taudin oireita. Hyoscyamiinia käytetään myös kuivausaineena liiallisen syljenerityksen, nenän vuotamisen tai liiallisen hikoilun hillitsemiseen.